La amplitud y complejidad de IKIKO exige la existencia y buen funcionamiento de una estructura mundial organizativa.
Toma forma a partir de tres dimensiones.
- Comisión general: Es el cerebro del evento. Está constituido por un equipo internacional de personas, cuyo objetivo principal es garantizar el alma y la dirección de IKIKO, guardar sus principios éticos, solucionar los desafíos de la organización y decidir todo lo que no sea ya competencia de otra de las dimensiones de EMO. Su estructura interna intenta reproducir o reflejar la diversidad mundial.
- Foro de sedes: Se trata de un foro libre de mediadores o mediadoras. Las personas de representación de las sedes coinciden y se reúnen en él, discuten, comparten sus particularidades, aprenden mutuamente sobre su diversidad en términos de culturas, desafíos, etc. Esta experiencia enriquece la organización de IKIKO e influye en su política. Toda sede tiene derecho a contar con un representante en el foro.
- Civiencia SL: Es una empresa española creada en y por la Universidad de Sevilla, cuyo objetivo es la democratización de la ciencia. Se encarga de todo lo relativo a los aspectos científicos y técnicos del evento. Ello implica, por ejemplo, el diseño y realización del portal web, implementar las versiones lingüísticas o el foro de sedes, organizar el almacén de materiales y su navegador, diseñar y hacer realidad la revista científica, editar las publicaciones del evento y organizar el nivel o capa internacional.
